According to the original article (Swedish: https://www.svt.se/nyheter/inrikes/signal-lamnar-sverige-om-...), the reason for the armed forces to be against it is because they recently started advocating for its personnel to start using Signal to reduce eavesdropping, so backdooring Signal would decrease the armed forces security.
> Men Försvarsmakten är negativa och nyligen uppmanade försvaret sin personal att börja använda Signal för att minska risken för avlyssning.